V muzeu je možné navštívit:

• stálou expozici Plzeňská městská zbrojnice (největší dochovanou historickou zbrojnici v ČR)
• stálou expozici Pohledy do minulosti Plzeňského kraje: Archeologie
• stálou expozici Pohledy do minulosti Plzeňského kraje: Historie
• stálou expozici Umělecké řemeslo / Užité umění 

V rámci prohlídkové trasy lze navštívit např. klášterní jídelnu (letní refektář), klášterní ambity (křížovou chodbu), kapitulní síň s kaplí sv. Barbory nebo klášterní zahradu (rajský dvůr).

Vystavené exponáty tvoří výtvarná díla různých historických epoch, bohoslužebné náčiní, roucha, ale nechybí tu ani texty, které uvádějí tyto předměty do souvislostí s křesťanským životem a vysvětlují jejich význam.

Příběh piva od středověku po současnost v muezu je možné vidět nejmenší džbánek na světě, pivovarskou laboratoř nebo gotickou sladovnu.

Docela jiný svět v Zoologické a botanické zahradě města Plzně

Nejzápadnější z českých zoologických zahrad působící od r. 1963 v Plzni na Lochotíně.

Loutky těší a baví po mnoho let již celé generace lidí, ale i loutky mají své osobité příběhy. Některé kočovaly s divadly, jiné rozesmály tisíckrát celé publikum, některé vystupovaly v děsivých dětských snech nebo se proslavily po celém světě.